Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET52

Cts6, Cathepsin-6, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts6Q9ET52 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cts6Q9ET52 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cts6Q9ET52 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cts6Q9ET52 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cts6Q9ET52 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms