Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pgpep1Q9ESW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pgpep1Q9ESW8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pgpep1Q9ESW8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pgpep1Q9ESW8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pgpep1Q9ESW8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pgpep1Q9ESW8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgpep1Q9ESW8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pgpep1Q9ESW8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pgpep1Q9ESW8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pgpep1Q9ESW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pgpep1Q9ESW8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pgpep1Q9ESW8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms