Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn12Q9ER56 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn12Q9ER56 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Capn12Q9ER56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Capn12Q9ER56 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms