Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ropn1lQ9EQ00 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ropn1lQ9EQ00 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ropn1lQ9EQ00 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms