Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms