Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr1Q9EPQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr1Q9EPQ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tlr1Q9EPQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tlr1Q9EPQ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tlr1Q9EPQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tlr1Q9EPQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tlr1Q9EPQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tlr1Q9EPQ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tlr1Q9EPQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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