Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan4Q9DCK3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan4Q9DCK3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms