Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Eif3fQ9DCH4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3fQ9DCH4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eif3fQ9DCH4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Eif3fQ9DCH4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms