Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc97Q9DBT3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc97Q9DBT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc97Q9DBT3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms