Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcg8Q9DBM0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg8Q9DBM0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg8Q9DBM0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcg8Q9DBM0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcg8Q9DBM0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Abcg8Q9DBM0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcg8Q9DBM0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms