Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBH5

Lman2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman2Q9DBH5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lman2Q9DBH5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lman2Q9DBH5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lman2Q9DBH5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lman2Q9DBH5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms