Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smco2Q9DA21 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smco2Q9DA21 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smco2Q9DA21 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms