Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pradc1Q9D9N8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pradc1Q9D9N8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms