Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo2Q9D8S4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rexo2Q9D8S4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rexo2Q9D8S4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rexo2Q9D8S4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms