Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vstm5Q9D806 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vstm5Q9D806 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vstm5Q9D806 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms