Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cul5Q9D5V5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cul5Q9D5V5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cul5Q9D5V5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cul5Q9D5V5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms