Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3404Q9D506 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3404Q9D506 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3404Q9D506 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3404Q9D506 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms