Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed11Q9D2R4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Tmed11Q9D2R4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmed11Q9D2R4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmed11Q9D2R4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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