Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp3Q9D032 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp3Q9D032 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp3Q9D032 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms