Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Zcchc8Q9CYA6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc8Q9CYA6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc8Q9CYA6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc8Q9CYA6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms