Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gtpbp8Q9CY28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp8Q9CY28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtpbp8Q9CY28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp8Q9CY28 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms