Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mis12Q9CY25 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mis12Q9CY25 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mis12Q9CY25 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms