Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX80

Cygb, Cytoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CygbQ9CX80 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CygbQ9CX80 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CygbQ9CX80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CygbQ9CX80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CygbQ9CX80 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CygbQ9CX80 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CygbQ9CX80 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms