Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ddx47Q9CWX9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx47Q9CWX9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx47Q9CWX9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx47Q9CWX9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx47Q9CWX9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx47Q9CWX9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ddx47Q9CWX9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx47Q9CWX9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddx47Q9CWX9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx47Q9CWX9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx47Q9CWX9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms