Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx10Q9CWT3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx10Q9CWT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx10Q9CWT3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms