Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smurf1Q9CUN6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Smurf1Q9CUN6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smurf1Q9CUN6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smurf1Q9CUN6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smurf1Q9CUN6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smurf1Q9CUN6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smurf1Q9CUN6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smurf1Q9CUN6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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