Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rprd1bQ9CSU0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rprd1bQ9CSU0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rprd1bQ9CSU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rprd1bQ9CSU0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms