Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pard3bQ9CSB4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pard3bQ9CSB4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pard3bQ9CSB4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pard3bQ9CSB4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.8 ms