Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NmbQ9CR53 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NmbQ9CR53 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmbQ9CR53 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmbQ9CR53 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms