Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klhl28Q9CR40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klhl28Q9CR40 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl28Q9CR40 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms