Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gkn1Q9CR36 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gkn1Q9CR36 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gkn1Q9CR36 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms