Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FanclQ9CR14 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FanclQ9CR14 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FanclQ9CR14 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FanclQ9CR14 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FanclQ9CR14 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms