Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chchd5Q9CQP3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd5Q9CQP3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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