Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med21Q9CQ39 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med21Q9CQ39 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med21Q9CQ39 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med21Q9CQ39 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms