Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms