Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acss1Q99NB1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Acss1Q99NB1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Acss1Q99NB1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Acss1Q99NB1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms