Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gps1Q99LD4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gps1Q99LD4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gps1Q99LD4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms