Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NgrnQ99KS2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NgrnQ99KS2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NgrnQ99KS2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NgrnQ99KS2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms