Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf19Q99KP6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prpf19Q99KP6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prpf19Q99KP6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prpf19Q99KP6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms