Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps4Q99KG7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hps4Q99KG7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps4Q99KG7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Hps4Q99KG7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hps4Q99KG7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms