Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lims1Q99JW4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lims1Q99JW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lims1Q99JW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lims1Q99JW4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms