Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec3Q99J72 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apobec3Q99J72 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apobec3Q99J72 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms