Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc8b1Q925Q3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc8b1Q925Q3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc8b1Q925Q3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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