Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trps1Q925H1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trps1Q925H1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trps1Q925H1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trps1Q925H1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trps1Q925H1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trps1Q925H1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trps1Q925H1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trps1Q925H1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trps1Q925H1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms