Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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Rnf144aQ925F3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Rnf144aQ925F3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Rnf144aQ925F3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rnf144aQ925F3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Rnf144aQ925F3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf144aQ925F3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rnf144aQ925F3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Rnf144aQ925F3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Rnf144aQ925F3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Rnf144aQ925F3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Rnf144aQ925F3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rnf144aQ925F3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Rnf144aQ925F3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Rnf144aQ925F3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Rnf144aQ925F3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Rnf144aQ925F3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnf144aQ925F3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rnf144aQ925F3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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