Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msi2Q920Q6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Msi2Q920Q6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Msi2Q920Q6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms