Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med28Q920D3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med28Q920D3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Med28Q920D3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms