Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atl3Q91YH5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atl3Q91YH5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atl3Q91YH5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atl3Q91YH5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atl3Q91YH5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms