Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Creb3l3Q91XE9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Creb3l3Q91XE9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Creb3l3Q91XE9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Creb3l3Q91XE9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Creb3l3Q91XE9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Creb3l3Q91XE9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Creb3l3Q91XE9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Creb3l3Q91XE9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Creb3l3Q91XE9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Creb3l3Q91XE9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms