Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps36Q91XD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps36Q91XD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps36Q91XD6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps36Q91XD6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms